I. 背景 | |
hCov-HKU1于2005年在香港发现,是上呼吸道和下呼吸道自限性感染的常见原因,最常见于幼儿。没有实验室诊断,通常通过呼吸道样品的逆转录聚合酶链反应(RT-PCR),HCoV-HKU1呼吸道感染无法与其他呼吸道病毒引起的感染区分开。治疗应具有症状且符合支持病毒性呼吸道感染的一般指南。
根据CDC和WHO的介绍,针对 hCov-HKU1的核酸诊断一般是针对RdRP (RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E, Gene S更多用于对应药物和疫苗的开发。NCBI收录序列为KF686346,全长29982,基因编码5个结构蛋白:S,M,N,HE和E。 以往针对试剂盒检测限的性能评价,一般是选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品,用于性能评价。但是两者都具有很明显的确定,首先体外转录的RNA,一般是很纯,单一,不涉及提取,不符合临床病毒的微环境,因此必然造成检测灵敏度被高估,这也是存在高概率假阴性的主要原因;再次临床阳性病毒,即使是灭活的病毒,也是存在很大的生物安全隐患,因此要求实验室级别为P3-P4,大部分开发诊断试剂盒单位都不满足改要求,另外临床阳性病毒也是来源很有限,不能被稳定供应,反复用于试剂盒的性能评价。 |
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II.产品描述 | |
有病毒的完整包膜结构,有HCoV-HKU1对应的核酸序列,但是生物安全风险较低的假病毒标准品,完美的克服了选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品的缺点,非常适合用于核酸诊断性能评价的标准品。 构建过程:HCoV-HKU1基因合成→假病毒包装→纯化→QC检测(ddPCR) |
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III. 产品介绍 | |
产品名称: | hCov-HKU1-E Pseudovirus Standard Reference |
对应序列(详情见附录): |
Gene E(249bp) |
产品规格: | 1ml |
拷贝数: | >1x10e7copies/ml |
生物安全级别: | P2 |
运输与保存方式: | 干冰运输,-90 ~ -70°C保存 |
有效期: | |
IV. 产品用途与优势 | |
产品用途: | HCoV-HKU1诊断试剂盒性能评价 |
产品优势: | • HCoV-HKU1的假病毒标准品,区别于以往体外合成的RNA、临床阳性活病毒,完美克服两者的缺点,真正适合用于试剂盒的性能评价,包含检测限、特异性,重复性等;
• 根据HCoV-HKU1冠状病毒的特点,选取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合计3个区段的序列,用于假病毒的包装,3个区段很好的表征了HCoV-HKU1的特征序列; • 3044am永利集团设计了ddPCR体系的引物、探针序列,可不需要构建标准曲线的前提下完成对假病毒的QC拷贝数检测,非常准确表征标准品的拷贝数,而且克服了Q-PCR分析CT值的相对判断标准的不准确性; • 假病毒标准品,无致病性,可再生,质控方法可靠,批次间稳定,可以长期稳定制备和供应,而且要求实验室生物安全级别为P2,满足很多单位的安全需求。 |
Ⅴ. 附录 | |
Gene E: ATGGTTGATTTATTTTTCAATGATACTGCTTGGTACATAGGACAGATTTTAGTTTTAGTTTTATTTTGTCTTATTTCTTTAATCTTTGTTGTTGCTTTTTTAGCAACTATTAAGCT TTGTATGCAACTTTGTGGTTTTTGTAATTTCTTTATTATTTCACCTTCGGCTTACGTTTATAAAAGAGGTATGCAGTTGTATAAGTCTTATAGTGAACAAGTTATACCACCCACTT CAGATTATTTAATCTAA |