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热门肿瘤标志物

背景

 肿瘤标志物是指在恶性肿瘤的发生和增殖过程中,由肿瘤细胞本身所产生的或是由机体对肿瘤细胞反应而异常产生和(或)升高的,反映肿瘤存在和生长的一类物质,包括蛋白质、激素、酶(同工酶)、多胺及癌基因产物等,存在于患者的血液、体液、细胞或组织中,可用生物化学、免疫学及分子生物学等方法进行测定,对肿瘤的辅助诊断、鉴别诊断、疗效观察、复发监测以及预后评估具有一定的临床诊疗价值。

热门肿瘤标志物

      MRD是指治疗后体内残留的肿瘤细胞或者标志物,通常的翻译有3种,微小残留病灶(Minimal Residual Disease)、可检测残留病灶(Measurable Residual Disease)、分子残留病灶(Molecular Residual Disease)。
      现有的针对ctDNA的MRD检测主要有2条技术路线:tumor-agnostic -assays(肿瘤未知分析)和tumor-informed assays(肿瘤知情/先验分析),其中tumor-agnostic -assays仅对血浆检测,利用的是固定的panel(一般为驱动基因和靶向药物基因,也会多组学方法)和分析方法对ctDNA做检测,做分析,代表产品Guardant Health公司的Guardant Reveal;tumor-informed assays需要对原发肿瘤组织进行测序(一般为WES),来鉴定患者的特异基因组变异图谱,然后再定制个性化的panel,针对ctDNA做检测,也就是说需要对组织和血浆都做检测,代表产品为Natera公司的Signatera。

 

     MRD技术难度很大的一个方面是对超低频突变的检测能力和稳定性,以非小细胞肺癌为例,在早期NSCLC患者血浆中位cfDNA的浓度为7.69 ng/mL,换算在10 mL血浆(20ml全血)中含有大概20,000个单倍体基因组(3.3pg),考虑到cfDNA建库时的损耗以及至少存在2条相同的变异基因序列,10 mL血浆中ctDNA检测到的极限分子信号为0.02%水平,另外, 从TRACERx研究数据推算, 在1 cm3体积的肿瘤情况下, 10 mL血浆中大概含有2条肿瘤来源DNA分子。因此, 在NSCLC中进行MRD检测时, 该检测方法必须可稳定检测出丰度≥ 0.02%的ctDNA。这里有个重要的技术策略,就是Sample Level的策略,对于Site level的0.02%甚至更低,可以通过Samples Level来提高灵敏度。




 


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